Africa-Places.com ने मापुटो में लगभग 15 गैर लाभकारी संगठन को सूचीबद्ध किया है। मापुटो के कुछ टॉप रेटेड गैर लाभकारी संगठन हैं। आईओएम मोज़ाम्बिक, आईओएम मोज़ाम्बिक, आईओएम मोज़ाम्बिक, संयुक्त राष्ट्र पर्यावास, अफ्रीका मोज़ाम्बिक, सामुदायिक भूमि के लिए फाउंडेशन पहल, सामुदायिक भूमि के लिए फाउंडेशन पहल, फ्रेडरिक-एबर्ट-स्टिचुंग, विकास सहयोग के लिए इतालवी एजेंसी & फ्रेडरिक-एबर्ट-स्टिचुंग।